寄宿舎は男子寮（１０室）と女子寮（１１室）があります。 男子寮・女子寮それぞれ１名ずつ、五島高校の教員が舎監として交替で泊まります。
写真は左が寮の外観です。右が食堂の様子です。 食事は毎日３食提供され、昼は弁当が作られます。（週に１度、弁当がパン等となります）
１部屋に２～４名生活しており、各部屋には学習机・電気スタンド・電気炬燵などが備え付けられています。 写真は左が男子の部屋、右が女子の部屋です。ともに同じ造りとなっています。
